Фильм режиссера Ридли Скота, бюджет которого составляет 97 миллионов долларов, является приквелом знаменитой истории о внеземной жизни, старающейся поработить вселенную, расе живых существ которые используют людей для увеличения своей популяции, выращивая потомство внутри человека, которым было дано название Чужие.
Единственный человек, Элизабет Шоу, который выжил в экспедиции звездолета «Прометей», восстанавливает робота андроида, по имени Дэвид, после чего они направляются по заданному курсу. Во время полета Шоу погружается в криосон, корабль под свое управление берет андроид Дэвид, который за время пути приходит к выводу о том что человечество обречено на вымирания, в отличии от иных форм жизни, в число которых он включает себя.
После этого прилетев на одну из планет Дэвид уничтожает все ее население вирусом найденным на базе Создателей ранее.
По прошествии 10 лет, от указанных событий, в 2104 году, космический корабль, с 2000 поселенцами на борту и пятнадцати членами экипажа, попадает под воздействие нейтронной вспышки, в связи с чем весь экипаж андроидом по имени Уолтер Разбужен и приступает к устранению полученных неисправностей. В это время кораблем получен сигнал с одной из планет, в ходе изучения состояния которой выясняется что она пригодна для жизни. Данной планетой является та на которую ранее прилетел «Прометей», и где андроид Дэвид уничтожил население, выпустив вирус со спорами Чужого.
Часть экипажа спускается на планету и начинает ее изучение, в ходе которого заражаются вирусом двое человек, и из них выходят Чужые. В борьбе с ними уничтожается посадочный корабль. впоследствии Чужие нападают на спустившихся членов экипажа которых спасает от гибели андроид Дэвид, который уводит выживших в здание созданное людьми которые ранее проживали на планете и были уничтожены вирусом, который выпустил Дэвид.
В последующем часть экипажа узнает что Дэвид виновен в том что население планеты было уничтожено. В схватку с ним вступает его точная копия андроид Уолтер. Кто из них выжил неизвестно. Спасать высадившихся на планету прибыли оставшиеся на борту основного корабля члены экипажа, которые спускают его в атмосферу планеты и на грузовой платформе подбирают выживших.
Спасенные ожидают что все их злоключения позади, но оказывается что на корабль проник Чужой. А также выясняется что ранее в схватке победил андроид Дэвид, который и пронес под видом Уолтера вирус на корабль. Осуществляя свой коварный план он распространяет вирус по кораблю уничтожая экипаж и направляясь со спящими поселенцами на борту к иным планетам.
